ELISA試劑盒為您解析細胞遺傳學工具的演化

    藍圖，ELISA試劑盒是工程制圖的原圖經(jīng)過描圖、曬圖和薰圖后生成的復制品，因為圖紙是藍色的，所以被稱為“藍圖”。人類基因組也常常被稱為“藍圖”。從某種意義上說，它的確是?；蚪M包含了構(gòu)建和運轉(zhuǎn)細胞、組織或生物體所需的所有信息。然而，藍圖是不變的，而基因組卻不是。

    隨著細胞生長和分裂，分化并形成配子，細胞的遺傳物質(zhì)在不斷變化。有時是單堿基的變化，有時卻是大規(guī)模的改變，從小的插入缺失（indel）到大的結(jié)構(gòu)變化，比如倒位、缺失、插入和易位。這一研究領(lǐng)域被統(tǒng)稱為“細胞遺傳學”。

    細胞遺傳學在一些先天性疾病的診斷中發(fā)揮了重要作用，比如唐氏綜合征（21三體）、慢性粒細胞白血?。–ML）等。核型分析是zui早出現(xiàn)的研究技術(shù)，一直沿用至今。之后研究人員將分子生物學技術(shù)應(yīng)用在細胞遺傳學中，促進了分子細胞遺傳學的興起和迅速發(fā)展。如今，我們的選擇更加廣泛，除了熒光原位雜交（FISH），還有比較基因組雜交（CGH）、新一代測序等。

從核型分析到FISH

    ELISA試劑盒對有絲分裂中期的細胞進行染色，通過顯微鏡拍照獲得它們的影像，根據(jù)它們的大小，條紋以及著絲點所在的位置進行排列整合，這就是核型分析。經(jīng)驗豐富的研究人員可通過這種技術(shù)來檢測大規(guī)模的核型變化，如染色體數(shù)目的變異（非整倍體）、染色體融合，大規(guī)模的插入缺失和易位等。然而，這種方法的度較差，對于復雜的染色體異常，或較小片段的缺失重復，往往難以正確判斷。生物通 www.ebiotrade.com

    熒光原位雜交（FISH）則是細胞遺傳學與分子技術(shù)的結(jié)合。根據(jù)DNA雙鏈堿基配對的原理，設(shè)計與待檢測區(qū)域DNA序列互補的單鏈核苷酸序列，并用熒光染料進行標記，制成檢測用的探針。將檢測細胞/組織的染色體暴露后進行高溫變性，使其DNA雙鏈解鏈，再與探針進行低溫孵育，使探針與相配對的染色體序列雜交，zui后在熒光顯微鏡下觀察探針的熒光信號來判斷這些探針所結(jié)合的染色體區(qū)域是否有突變。

    ELISA試劑盒FISH打破了常規(guī)細胞遺傳學分析的諸多限制，讓間期細胞也能進行檢測，在某些疾病的檢測方面，檢出率可達染色體條帶技術(shù)的兩倍，所需時間也更短，因此成為產(chǎn)前診斷和血液病檢測中的重要工具。當然，目前的FISH探針還有限，單個探針只能檢測特定片段的重復、丟失或重排，而不提供余下基因組的其他信息。因此，在臨床應(yīng)用中，F(xiàn)ISH往往與核型分析一起做。

從芯片到測序

    如今，為了獲得更高分辨率的結(jié)果，研究人員使用DNA芯片來產(chǎn)生所謂的“虛擬核型”。這種芯片包含了與整個或部分基因組雜交的探針，通過比較每個探針的雜交強度，細胞遺傳學家可確定特定區(qū)域是否缺失或擴增。這一類型的分析被稱為基于芯片的比較基因組雜交（array CGH，aCGH）。

    虛擬核型分析在技術(shù)上比傳統(tǒng)核型分析更為簡單，分辨率也更高。從理論上說，aCGH可檢測到影響單個探針的拷貝數(shù)改變，但實際上，研究人員通常設(shè)定閾值，檢測影響幾個相鄰探針的改變。

    ELISA試劑盒因不同公司而異，芯片可能包含了檢測單核苷酸多態(tài)性（SNP）或拷貝數(shù)變異（CNV）的探針，或二者皆有。例如，Affymetrix的CytoScan® HD芯片含有超過260萬個用于拷貝數(shù)檢測的探針，其中75萬個為SNP探針，190萬個為非多態(tài)性探針。這樣能夠在單塊芯片上檢測獲得、丟失、雜合性丟失（LOH）、血緣一致性區(qū)域和單親二體?。║PD），從而實現(xiàn)高分辨率的DNA拷貝數(shù)分析。

    而Illumina的產(chǎn)品主要關(guān)注SNP檢測。Illumina創(chuàng)新的Infinium HD技術(shù)允許自由選擇SNP或探針，實現(xiàn)了基因組的密集均一覆蓋，且能夠靶定高價值的基因組區(qū)域。從HumanCytoSNP-12 BeadChip芯片的30萬個標記物到 HumanOmni5-Quad BeadChip芯片超過400萬個標記物，Infinium HD BeadChip芯片支持了高分辨率的拷貝數(shù)和LOH分析，平均標記物間隔低至1 kb。

    此外，安捷倫也提供aCGH芯片，用于基因的拷貝數(shù)檢測和染色體結(jié)構(gòu)變化檢測。這種芯片覆蓋全基因組，在包括基因區(qū)域（內(nèi)含子區(qū)、外顯子區(qū)）、基因間區(qū)域以及對疾病研究極其重要的亞端粒區(qū)域（但不包含重復序列）的分布大致相同。

    aCGH芯片目前也應(yīng)用在臨床中，以檢測非整倍體、已知的微缺失或是微復制綜合征，或其他非平衡性染色體重排。這些多數(shù)為靶向芯片。與全基因組aCGH相比，它僅僅應(yīng)用了已知染色體重排區(qū)域的克隆，常用于出生缺陷、精神發(fā)育遲緩或智能發(fā)育障礙、疑為染色體異?；純旱呐R床診斷。

    在當今這個以基因組學為中心的年代，分子細胞遺傳學無疑還有另外一個選擇：新一代測序。倘若測序深度足夠，對讀取的密度、位置或間隔的分析從理論上能夠定位結(jié)構(gòu)和拷貝數(shù)變異，并且達到了近乎核苷酸的分辨率。相比之下，芯片分辨率大抵在kb數(shù)量級。

    當然，這只是理論。新一代測序?qū)嶒炛泄逃械淖兓沟米x取轉(zhuǎn)化成結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)絕非易事。不過，目前研究人員已經(jīng)開發(fā)出一些策略，包括CNV-seq、ABCD-DNA、CNVnvator和cnvHiTSeq等。去年底，華裔學者謝曉亮證明了CNV分析可在單細胞水平開展。

    當然，在考慮細胞遺傳學時，請記住，實現(xiàn)這門技術(shù)需要經(jīng)費，而獲得經(jīng)驗需要時間。對某些實驗室而言，初期的投入可能有意義。但對于其他人來說，外包給專業(yè)機構(gòu)也許是個不錯的選擇。